Early growth response 3 (egr3) is highly over-expressed in non-relapsing prostate cancer but not in relapsing prostate cancer.
初期の成長応答3（egr3）は、再発性前立腺癌でなく非再発性前立腺癌で非常に過剰発現する。
2013-01-14
Department of Pathology and Laboratory Medicine, University of California Irvine, Irvine, California, United States of America.
Abstract
Members of the early growth response (EGR) family of transcription factors play diverse functions in response to many cellular stimuli, including growth, stress, and inflammation. Egr3 has gone relatively unstudied, but here through use of the SPECS (Strategic Partners for the Evaluation of Predictive Signatures of Prostate Cancer) Affymetrix whole genome gene expression database we report that Egr3 mRNA is significantly over-expressed in prostate cancer compared to normal prostate tissue (5-fold). The Human Protein Atlas (http://www.proteinatlas.org), a database of tissue microarrays labeled with antibodies against over 11,000 human proteins, was utilized to quantify Egr3 protein expression in normal prostate and prostate cancer patients. In agreement with the SPECS data, we found that Egr3 protein is significantly increased in prostate cancer. The SPECS database has the benefit of extensive clinical follow up for the prostate cancer patients. Analysis of Egr3 mRNA expression in relation to the relapse status reveals that Egr3 mRNA expression is increased in tumor cells of non-relapsed samples (n = 63) compared to normal prostate cells, but is significantly lower in relapsed samples (n = 38) compared to non-relapse. The observations were confirmed using an independent data set. A list of genes correlating with this unique expression pattern was determined. These Egr3-correlated genes were enriched with Egr binding sites in their promoters. The gene list contains inflammatory genes such as IL-6, IL-8, IL1β and COX-2, which have extensive connections to prostate cancer.
Egr3は比較的未研究になった、しかし、ここではSPECS（Prostate CancerのPredictive SignaturesのEvaluationのための戦略的なパートナー）Affymetrix全体ゲノム遺伝子発現データベースを用いることにより、我々はEgr3 mRNAが正常な前立腺の組織（5倍）と比較して前立腺癌で有意に過剰発現すると報告する。
Human Proteinアトラス（http://www.proteinatlas.org）（11,000以上のヒト・タンパク質に対して抗体についてのラベルがついている組織マイクロアレイのデータベース）は、正常な前立腺と前立腺癌患者のEgr3タンパク質表現を定量化するために利用された。
SPECSデータと一致して、我々は、Egr3タンパク質が前立腺癌で有意に増加するとわかった。
SPECSデータベースには、前立腺癌患者のために広範囲な臨床追跡の有益性がある。
再発の状態に関するEgr3 mRNA発現の分析で、Egr3 mRNA発現が正常な前立腺の細胞と比較して非再発検体（n = 63）の腫瘍細胞で増加するが、非再発と比較して再発試料（n = 38）が有意により少ないことが分かる。
観察は、独立データセットを使用して確認された。
この固有の発現パターンと相関している遺伝子のリストは、決定された。
これらのEgr3相関している遺伝子は、それらのプロモーターでEgr結合部位で豊かにされた。
遺伝子リストはIL-6、IL-8、IL1βとCOX-2のような炎症性遺伝子を含む。
そして、それには前立腺癌との広範囲なつながりがある。
